消毒柜的种类较多，其中最主要的是远红外线消毒柜和臭氧消毒柜。
远红外线消毒柜主要是根据物理原理，利用远红外线发热，进行杀菌消毒。用远红外线消毒时，消毒柜的温度必须达到125℃，而且需持续保持15分钟，才能把对人体有害的大肠杆菌及肝炎病毒等杀死。这种消毒方式具有速度快、穿透力强的特点，生活中常用的餐具都可放在柜内进行高温消毒。但这种消毒柜温度控制难掌握。如果温度过高或时间过长，则容易损坏餐具；如果温度过低或时间太短，则不能彻底消毒。
臭氧消毒柜是利用臭氧发生器在柜内产生高浓度臭氧将细菌杀灭。但臭氧并不能彻底消毒，比较客观地说，目前的臭氧消毒柜只能起到保洁作用。另一方面，臭氧材料容易氧化，还有待于进一步改进。
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